Воронежский заповедник расположен в центральной части Европейской России, по административно-территориальному делению входит в состав Центрального Федерального округа. Площадь заповедника 31053 га.

Территория заповедника находится на границе Воронежской (Верхнехавский и Рамонский р-ны) и Липецкой (Усманский р-н) областей и занимает северную половину островного лесного массива — Усманского бора.

Географические координаты: 51°52'— 52°02' северной широты, 39°21'— 39°47' восточной долготы.

На южной границе заповедника находится поселок Краснолесный (по железной дороге — станция Графская), на западной — областной центр Рамонь, на северной — липецкая Усмань. По периметру заповедника расположены 18 населенных пунктов.

В 40 км к югу от заповедника находится г. Воронеж — индустриальный, научный и историко-культурный центр Черноземья; в 100 км к северу — Липецк — крупный промышленный город региона. С областными центрами Воронежской и Липецкой областей заповедник связан автомобильным и железнодорожным сообщением.

При обнаружении пожара, браконьерства и других нарушений заповедного режима также можно обращаться по телефону заместителя директора Воронежского заповедника в области охраны окружающей среды: 8 961 186 38 00 (Мирошниченко Владимир Григорьевич)